Le musée de Semur-en-Auxois abrite des collections très variées : une galerie des plâtres, une salle de paléontologie, une salle d'archéologie, une salle Beaux-Arts, une salle de zoologie et deux salles sur le Moyen-âge.
D'une pointe de flèche paléolithique aux tableaux de Corot, tout un univers encyclopédique et artistique est exposé au musée.